故事设定在现代北京的一个古老针灸世家，居住在故宫边上的一个四合院里，代代相传针灸绝技，治愈过上至达官贵人下至街头百姓各色人等的疑难病痛。多年前的一场重大变故，家传医籍《灵枢针灸谱》被人带入故宫，从此沓无音讯，致使之后的传人只能治愈一半病症。世家现代传人杨飞宇在爷爷杨老神医指点下，掌握了精湛医术，并临危救治了后来成为他女友的苏婉儿。因对中医缺乏了解而嘲笑抵触的青年女西医专家林心怡，与杨苏二人几经碰撞，最终理解了中医和针灸的博大精深。她还协助杨苏一起去故宫寻找到了遗失的医籍，了却了杨老神医的宿愿，大家还携手粉碎了医药界大佬赵铁心企图将医籍据为己有并高价售往国外的图谋。
